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대한비뇨기과학회 연구 지원 사업 - 유전체 정보분석 전문가 기본과정-I 교육생 모집안내 (Python for Precision Medicine)

학회 717 2018-10-02

유전체 정보분석 전문가 기본과정1

   Python for Precision Medicine

임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 통계학적 도구 사용의 중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다. 공개 소프트웨어인 Python은 현재 다양한 분야에서 활용가능한 효율적 프로그래밍 언어로 자리잡았습니다. 서울의대 정보의학실에서는 바이오정보학과 의과학 분야에서 Python의 활발한 보급을 위한 실습 웍샵을 마련했습니다. 본 교육과정이 실질적인 생명의과학 데이터와 유전체 데이터의 분석을 위한 Python 활용의 기초가 되기를 기원합니다.

-  2018년 10월 서울대학교병원 유전체 임상 정보분석 훈련센터장 김주한


일시 및 장소


일 시 : 2018112() ~ 113() 오전 9시 ~ 오후 5시                   

장 소 : 서울대 의과대학 의학도서관 3층 전산실습실
주 최 : 보건복지부
주 관 : 한국보건복지인력개발원, 서울대학교병원
인 원 : 30명 제한, 이틀 강좌 등록비 무료, 강의교재 제공

프로그램 (Day 1)

시 간

주 제
9:00 ~ 9:10

등  록

9:10 ~ 9:30 Introduction to Python
9:30 ~ 10:40 Starting with Python
- Introduction to Python

- Python installation, workspace, Python package installation
- Basic Functions of Python (for, while, if)
10:50 ~ 12:00 Data Structures of Python
- List, Tuple, Set

- Queue, Stack
- Dictionary
- Numpy
12:00 ~ 13:10 중  식 
13:10 ~ 14:20

Functions of Python
- Using Editor

- Useful Modules(os, sys, glob, urllib, Time)

- Defining Function

- Error and Exceptions

14:30 ~ 15:40

Regular expressions
- Managing File
- Introduction to Regular expression
- Grdeey vs Non-Greedy Match
- Main methods

15:50 ~ 17:00

Bioinformatics Practice
- Calculating GC contents ratio of Human genome
- Collection Data from RefFlat files
- Data Manipulation with MAF(Mutation Annotated Format) Files


프로그램 (Day 2)

시 간

주 제
9:10 ~ 9:30 Application of Python
9:30 ~ 10:40 Medical Informatics Practice 1
-
MESH (Medical Subject Headings)
- ICD ( The International Classification of Disease)
10:50 ~ 12:00 Medical Informatics Practice 2
- SEER(The Cancer Surveillance, Epidemiology and End Results Program)

-
CDC (Centers for Disease Control And Prevention) Mortality Files
- FDR
12:00 ~ 13:10 중  식 
13:10 ~ 14:20

Defining Class
-
Class Definition Syntax
- Instance Objects

- Method Objects
- Inheritance

14:30~ 15:40

Python Machine Learning
- TensorFlow
- Keras
- Theano

15:50 ~ 17:00

Python Visualization
- Matplotlib
- Seaborn
- Bokeh
- Plotly


등 록



  • 교육대상:

    (1) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자
    (2) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자
    (3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 재직자 및 창업 (준비)자

  • 지원절차:

    서류 전형 및 합격자 개별 통지
    원서교부 및 접수기간 : 2018. 8. 30 ~ 2018. 10. 5
    제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출
    사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com)
    홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course8.html
    지원방법 : 이메일 혹은 직접 제출 (우편 접수 불가)
    합격자 발표일시 : 2018.10.12. (예정)

지원서 다운로드


실습 컴퓨터

실습실에 컴퓨터가 준비 되어있으므로, 개인 노트북은 준비 하지 않으셔도 됩니다.

 

오시는 길

 

장 소 : 서울대 의과대학 의학도서관 3층 전산실습실
교 통 : 지하철 4호선 혜화역 3번 출구
주 차 : 주차권을 판매하지 않는 관계로 가급적 대중교통을 이용하시기 바랍니다.