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대한비뇨기과학회 연구 지원 사업 - 유전체 정보분석 전문가 기본과정-II 교육생 모집안내 (R for Precision Medicine)

학회 934 2018-10-02

유전체 정보분석 전문가 기본과정2

R for Precision Medicine

임상 의료정보와 유전체 데이터의 통합분석에서 올바른 통계학적 도구 사용의 중요성은 아무리 강조해도 지나치지 않습니다. 공개 소프트웨어인 R statistical package는 풍부한 통계분석 라이브러리와 자료처리를 위한 컴퓨터 프로그래밍 환경 및 수준 높은 그래프 그리기를 지원합니다. 서울의대 정보의학실에서는 바이오정보학과 의과학 분야에서 R의 활발한 보급을 위한 실습 웍샵을 마련했습니다. 본 교육과정이 실질적인 생명의과학 데이터와 유전체 데이터의 분석을 위한 R 활용의 기초가 되기를 기원합니다.

- 2018년 10월 서울대학교병원 유전체 임상 정보분석 훈련센터장 김주한

■ 일시 및 장소

일 시 : 2018년 10월 26일(금) ~ 10월 27일(토) 오전 9시 ~ 오후 5시

장 소 : 서울대 의과대학 의학도서관 3층 전산실습실
주 최 : 보건복지부
주 관 : 한국보건복지인력개발원, 서울대학교병원
인 원 : 30명 제한, 이틀 강좌 등록비 무료, 강의교재 제공

■ 프로그램 (Day 1)

시 간	주 제
9:00 ~ 9:10	등 록
9:10 ~ 9:30	Introduction to R
9:30 ~ 10:40	Starting with R - R Installation, R packages, workspace - Data type and structure - Basic R functions: built in functions - File read and write
10:50 ~ 12:00	Data manipulation with R - Vector, matrix - Index, splice, conditional statement - Data management: sorting, merging, reshaping - Apply functions - User defined function
12:00 ~ 13:10	중 식
13:10 ~ 14:20	Statistical Analysis with Biomedical Data I - Distributions - Parametric tests - Non-Parametric stats
14:30 ~ 15:40	Statistical Analysis with Biomedical Data II - Correlation - Regression - ANOVA
15:50 ~ 17:00	Advanced R graphics and ggplot2 - Plot, histogram, qqplot, boxplot - Layout, axis, legend and text - ggplot2: scatterplot, histogram, boxplot, barplot, density plot - Error bar, line graph

■ 프로그램 (Day 2)

시 간	주 제
9:10 ~ 9:30	Machine Learning Algorithms for Biomedical Informatics
9:30 ~ 10:40	Microarray Data Analysis I - Introduction to Microarray Data - Normalization methods
10:50 ~ 12:00	Microarray Data Analysis II - Identifying DEG: t-test, SAM - Volcano plot - FDR
12:00 ~ 13:10	중 식
13:10 ~ 14:20	Classification using R - K-Nearest Neighbor - Support Vector Machine - Logistic regression - Feature selection
14:30~ 15:40	Evaluation and Validation - Cross validation - Train/validation/test set split - Empirical p-value, permutation test - Multiple testing - Mean squared error rate
15:50 ~ 17:00	Case study: association of BRCA1 and BRCA2 mutations with survival in ovarian cancer (JAMA 2011) - DEG extraction from RNA-seq data using TRAPR - Clustering (K-means, hierarchical) - Correlation analysis between methylation and expression data - Survival analysis

■ 등 록

교육대상:

(1) BT·IT 혹은 의학분야 전공 학부 졸업생, 관련 석·박사과정 및 학위 소지자
(2) 의료기관 및 공공기관, 연구중심병원, 유전체분석 업체 취업 희망자
(3) 유전체 관련 기업, 연구소 등 재직자 및 창업 (준비)자
지원절차:

서류 전형 및 합격자 개별 통지
원서교부 및 접수기간 : 2018. 8. 30 ~ 2018. 10. 5
제출서류 : 아래 첨부한 지원서 양식을 다운로드 받아 일괄 작성하여 사무국에 제출
사무국 : 02-740-8854 송민주 (bdpm.office@gmail.com)
홈페이지 : http://bitec.snubi.org/course7.html
지원방법 : 이메일 혹은 직접 제출 (우편 접수 불가)
합격자 발표일시 : 2018.10.12. (예정)

지원서 다운로드

■ 실습 컴퓨터

실습실에 컴퓨터가 준비 되어있으므로, 개인 노트북은 준비 하지 않으셔도 됩니다.

오시는 길

장 소 : 서울대 의과대학 의학도서관 3층 전산실습실
교 통 : 지하철 4호선 혜화역 3번 출구
주 차 : 주차권을 판매하지 않는 관계로 가급적 대중교통을 이용하시기 바랍니다.

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공지사항

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